在Linux上，有多种方法可以加密FTP传输。以下是两种常用的方法：

1. 使用FTPS（FTP Secure）：
   FTPS是FTP的一个扩展，它在FTP的基础上增加了SSL/TLS加密层，以确保数据传输的安全性。要配置FTPS，您需要一个支持SSL/TLS的FTP服务器软件，如vsftpd或ProFTPD。

以vsftpd为例，您可以按照以下步骤配置FTPS：

a. 安装vsftpd和OpenSSL：

sudo apt-get update
sudo apt-get install vsftpd openssl

b. 生成SSL证书和私钥：

sudo openssl req -x509 -nodes -days 365 -newkey rsa:2048 -keyout /etc/ssl/private/vsftpd.pem -out /etc/ssl/private/vsftpd.pem

按照提示输入相关信息，完成后会在指定目录生成证书和私钥文件。

c. 编辑vsftpd配置文件：

sudo nano /etc/vsftpd.conf

找到以下行并进行修改：

ssl_enable=YES
allow_anon_ssl=NO
force_local_data_ssl=YES
force_local_logins_ssl=YES
ssl_tlsv1=YES
ssl_sslv2=NO
ssl_sslv3=NO
rsa_cert_file=/etc/ssl/private/vsftpd.pem
rsa_private_key_file=/etc/ssl/private/vsftpd.pem

保存并退出。

d. 重启vsftpd服务：

sudo systemctl restart vsftpd

现在，您的FTP服务器已经配置为使用FTPS进行加密传输。

2. 使用SFTP（SSH File Transfer Protocol）：
   SFTP是SSH协议的一部分，它提供了一个安全的文件传输通道。与FTPS相比，SFTP不需要额外的证书和密钥管理。要使用SFTP，您需要一个支持SSH的FTP服务器软件，如OpenSSH。

以OpenSSH为例，您可以按照以下步骤配置SFTP：

a. 安装OpenSSH服务器：

sudo apt-get update
sudo apt-get install openssh-server

b. 编辑SSH配置文件：

sudo nano /etc/ssh/sshd_config

找到以下行并进行修改：

Subsystem sftp /usr/lib/openssh/sftp-server

保存并退出。

c. 重启SSH服务：

sudo systemctl restart ssh

现在，您的FTP服务器已经配置为使用SFTP进行加密传输。用户可以通过SFTP客户端连接到服务器，并使用加密通道进行文件传输。