在Ubuntu系统中，PHP日志中的超时错误通常是由于脚本执行时间超过了PHP配置文件中设置的最大执行时间。要解决这个问题，你可以尝试以下方法：

1. 修改PHP配置文件（php.ini）：

   找到你的php.ini文件。它通常位于/etc/php/{版本号}/apache2/或/etc/php/{版本号}/cli/目录下，其中{版本号}是你的PHP版本。例如，如果你使用的是PHP 7.4，路径可能是/etc/php/7.4/apache2/php.ini或/etc/php/7.4/cli/php.ini。

   使用文本编辑器打开php.ini文件，如sudo nano /etc/php/7.4/apache2/php.ini。

   在文件中找到max_execution_time设置，它表示脚本的最大执行时间（以秒为单位）。例如，将其设置为300秒：

   max_execution_time = 300
   

   保存并关闭文件。然后重启你的Web服务器（例如Apache或Nginx）以使更改生效。

   sudo systemctl restart apache2
   

   或

   sudo systemctl restart nginx
   

2. 在PHP脚本中使用set_time_limit()函数：

   在你的PHP脚本中，你可以使用set_time_limit()函数来设置脚本的最大执行时间。例如，将执行时间设置为300秒：

   set_time_limit(300);
   

   将此行添加到脚本的开头。请注意，这仅适用于CLI版本的PHP。如果你在Web服务器上运行脚本，建议使用第一种方法修改php.ini文件。

3. 检查代码性能：

   如果你的脚本需要很长时间才能完成，可能需要检查代码性能并进行优化。你可以使用性能分析工具（如Xdebug）来查找瓶颈并优化代码。

总之，要解决Ubuntu PHP日志中的超时错误，你可以尝试增加最大执行时间或优化代码性能。在大多数情况下，优化代码性能是更好的解决方案，因为它可以减少服务器负载并提高用户体验。